More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0099 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  74.81 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  67.92 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  63.4 
 
 		 259 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 		 255 aa  300  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  60.08 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  58.92 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  60.52 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  56.73 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  55.22 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  56.65 
 
 		 248 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  59.49 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  55.7 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  55.22 
 
 		 254 aa  271  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  54.13 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  54.7 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  51.61 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  45.67 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.89 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  46.78 
 
 		 273 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  48.91 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  50 
 
 		 289 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  51.93 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  49.57 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  47.83 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  45.3 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  47.21 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 296 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  45.92 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  44.35 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  46.38 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  45.99 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  45.99 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  45.99 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  47.26 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  44.8 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  46.61 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  46.61 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  43.88 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  47.93 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  46.81 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  44.72 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  44.78 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  44.88 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  44.78 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  45.38 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  44.49 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  44.9 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  44.49 
 
 		 296 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  44.14 
 
 		 311 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  44.98 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  44.44 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  45.3 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  45.26 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  47.58 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  48.35 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  44.84 
 
 		 299 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  44.87 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  44.92 
 
 		 297 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  44.92 
 
 		 297 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  42.8 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  43.51 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  47.19 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  43.51 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  43.51 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  43.51 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  42.49 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  43.51 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  45.18 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  37.76 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3453  ABC transporter related  44.12 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.859541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  42.67 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  44.74 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  40.35 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  41.77 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>