More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0096 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  60.35 
 
 		 788 aa  942    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3794  aldehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 783 aa  897    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3017  aldehyde dehydrogenase  70.08 
 
 		 780 aa  1103    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.828934  normal  0.325686 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3348  hypothetical protein  54.34 
 
 		 792 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  54.8 
 
 		 791 aa  800    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  57.39 
 
 		 798 aa  835    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5195  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  62.15 
 
 		 787 aa  926    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0786  aldehyde dehydrogenase  67.9 
 
 		 779 aa  1074    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2281  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  59.9 
 
 		 795 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.392437 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4632  aldehyde dehydrogenase  59.68 
 
 		 794 aa  906    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698936  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1400  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 		 796 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346772  normal  0.232291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1274  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.73 
 
 		 798 aa  928    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.117551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7827  putative membrane-anchored aldehyde dehydrogenase protein  61.73 
 
 		 795 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0096  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 780 aa  1596    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.61 
 
 		 791 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2836  aldehyde dehydrogenase  56.1 
 
 		 798 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4653  aldehyde dehydrogenase  61.61 
 
 		 797 aa  931    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197887  normal  0.568756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  57.92 
 
 		 792 aa  868    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3898  aldehyde dehydrogenase  55.17 
 
 		 776 aa  778    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1348  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 		 817 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0778  Betaine-aldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3529  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.86 
 
 		 484 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  56.99 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0742  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.97 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0364  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.32 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0771  aldehyde dehydrogenase  55.14 
 
 		 476 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.302759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0827  aldehyde dehydrogenase  55.14 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0476667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05500  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.21 
 
 		 479 aa  492  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4391  Betaine-aldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0798  Aldehyde Dehydrogenase  55.62 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0209  Aldehyde Dehydrogenase  55.14 
 
 		 477 aa  482  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3248  Betaine-aldehyde dehydrogenase  52.39 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.11 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.01 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 		 497 aa  366  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.06 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.06 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.4 
 
 		 490 aa  360  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 		 494 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.85 
 
 		 494 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 		 494 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.64 
 
 		 494 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 		 494 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 		 490 aa  353  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.83 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.5 
 
 		 473 aa  348  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  40.51 
 
 		 490 aa  347  5e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.7 
 
 		 494 aa  347  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 490 aa  346  7e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.15 
 
 		 498 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.27 
 
 		 494 aa  344  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  42.64 
 
 		 492 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 		 494 aa  343  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 		 494 aa  343  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.06 
 
 		 494 aa  343  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  44.07 
 
 		 503 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.85 
 
 		 494 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 494 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  43.74 
 
 		 496 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  41.31 
 
 		 491 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  43.43 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  38.97 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 492 aa  335  3e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 		 495 aa  334  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 495 aa  333  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  40.89 
 
 		 524 aa  332  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 		 494 aa  332  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.09 
 
 		 497 aa  331  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 510 aa  331  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.13 
 
 		 492 aa  331  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  42.31 
 
 		 508 aa  331  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 504 aa  331  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 		 505 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 497 aa  330  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.29 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 		 505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.21 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 		 489 aa  327  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  41.14 
 
 		 501 aa  327  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  40.69 
 
 		 494 aa  327  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 491 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4065  aldehyde dehydrogenase B  40.83 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.04 
 
 		 488 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4003  aldehyde dehydrogenase B  40.83 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 490 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3894  aldehyde dehydrogenase B  40.83 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03443  aldehyde dehydrogenase B  40.83 
 
 		 512 aa  324  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 502 aa  324  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>