216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0039 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0039  dipeptidase AC  100 
 
 		 349 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508075  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  55.46 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  55.46 
 
 		 355 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  54.6 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  55.08 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  51.45 
 
 		 342 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  50.57 
 
 		 355 aa  352  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  51.45 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  49.71 
 
 		 360 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  51.69 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  49.57 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  50.72 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  49.29 
 
 		 346 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  51.15 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  47.98 
 
 		 346 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  49.57 
 
 		 352 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  48.99 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  50.87 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  53.31 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  50.58 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  50.58 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.49 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  28.24 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.42 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  29.02 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.71 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.03 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  29.39 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  26.84 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  29.14 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.45 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.33 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  30.43 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.64 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  27.99 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  27.99 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  30.53 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  27.99 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  27.99 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.88 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  28.68 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  27.54 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  31 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  27.36 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  29.87 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  28.23 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.9 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  27.71 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  26.22 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  25.07 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  27.53 
 
 		 419 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.98 
 
 		 399 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  29.1 
 
 		 444 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  28.12 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  26.14 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  27.24 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  29.28 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.42 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25.7 
 
 		 429 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  24.15 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  26.2 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  27.84 
 
 		 412 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  29.78 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  34.08 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.36 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1296  peptidase M19 renal dipeptidase  35.53 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0672  peptidase M19, renal dipeptidase  24.73 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.94 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3958  peptidase M19 renal dipeptidase  29.74 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.561135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  28.69 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.78 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  29.34 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  26.14 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  24.56 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.05 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  26.2 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.01 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.96 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  26.26 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.1 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  31.95 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  28.68 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  25.09 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  25.94 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  25.99 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  26.87 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2247  peptidase M19 renal dipeptidase  30.18 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00766827  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  25.72 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  24.87 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>