279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0031 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0031  methylamine utilization protein MauG, putative  100 
 
 		 435 aa  884    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  0.24254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  61.23 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0114  di-haem cytochrome c peroxidase  48.04 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2749  putative cytochrome c peroxidase  47.73 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0452779 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3354  di-haem cytochrome c peroxidase  47.83 
 
 		 449 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  0.135039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3672  di-haem cytochrome c peroxidase  45.5 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0540  di-haem cytochrome c peroxidase  33.99 
 
 		 499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2247  putative methylamine utilization protein MauG precursor  29.27 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1545  Cytochrome-c peroxidase  30.9 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  29.9 
 
 		 768 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  30.45 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  30.65 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  29.64 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  29.45 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  31.9 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.95 
 
 		 626 aa  120  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  28.02 
 
 		 626 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  28.99 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  25.65 
 
 		 328 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  32.69 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  28.5 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  27.76 
 
 		 377 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  31.72 
 
 		 335 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.98 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  27.75 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  31.23 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  31.83 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  26.78 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 344 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 344 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  28.77 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  29.77 
 
 		 344 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  28.75 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  29.16 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  29.45 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  27.51 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  28.19 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  26.22 
 
 		 594 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1860  di-haem cytochrome c peroxidase  26.52 
 
 		 358 aa  103  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.39839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  28.73 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  28.2 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  29.25 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.49 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  28.88 
 
 		 607 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  26.34 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  29.14 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  27.51 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.83 
 
 		 616 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  28.94 
 
 		 333 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  28.18 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  28.64 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  28.88 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  29.39 
 
 		 347 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  28.48 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  28.3 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  28.21 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  28.3 
 
 		 333 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.57 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  27.69 
 
 		 473 aa  97.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  28.21 
 
 		 333 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  26.11 
 
 		 302 aa  96.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  28.83 
 
 		 340 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  27.99 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  28.65 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  29.07 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  29.07 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  27.14 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  25.71 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  26.81 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28.27 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.88 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  25.59 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  29.26 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.88 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  26.58 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.88 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  28.25 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  25.87 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  29.02 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  26.88 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  28.32 
 
 		 469 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  28.33 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  26.88 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  28.91 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 		 352 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2680  Cytochrome-c peroxidase  26.67 
 
 		 594 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  28.02 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  27.59 
 
 		 461 aa  93.2  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  28.85 
 
 		 348 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  28.9 
 
 		 346 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.75 
 
 		 352 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  27.55 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  26.87 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>