13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0026 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0026  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1154  hypothetical protein  38.97 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2815  hypothetical protein  38.97 
 
 		 204 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2773  hypothetical protein  38.97 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3851  hypothetical protein  34.36 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.855967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2607  hypothetical protein  34.52 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0227  hypothetical protein  34.02 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3587  hypothetical protein  31.96 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  25.51 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  26.7 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2904  hypothetical protein  25.91 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.796329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  25.13 
 
 		 246 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2342  hypothetical protein  22.41 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.25534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>