More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2595 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  100 
 
 
280 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  64.46 
 
 
286 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  56.84 
 
 
289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  56.45 
 
 
290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  56.45 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  57.99 
 
 
291 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  55.79 
 
 
290 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  57.54 
 
 
290 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  55.79 
 
 
290 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  55.79 
 
 
290 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  55.04 
 
 
286 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  55.75 
 
 
295 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  52.25 
 
 
292 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  54.98 
 
 
294 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  51.5 
 
 
304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  55.59 
 
 
290 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  51.19 
 
 
294 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  52.63 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  55.71 
 
 
290 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  50.86 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  54.9 
 
 
290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  55.17 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  55.02 
 
 
290 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  54.04 
 
 
290 aa  281  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  54.04 
 
 
288 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  57.24 
 
 
287 aa  278  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  51.16 
 
 
306 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  49.66 
 
 
292 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  49.66 
 
 
292 aa  274  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  53.99 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  51.21 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  50 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  48.8 
 
 
292 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  51.54 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  49.31 
 
 
292 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  49.31 
 
 
292 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  57 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  48.8 
 
 
292 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  48.8 
 
 
292 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  48.8 
 
 
292 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  48.8 
 
 
292 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  51.24 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  50.53 
 
 
295 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  49.15 
 
 
294 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  48.62 
 
 
300 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  49.48 
 
 
295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  49.16 
 
 
309 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  51.16 
 
 
311 aa  258  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  49.17 
 
 
303 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  49.48 
 
 
295 aa  258  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  50.34 
 
 
293 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  47.59 
 
 
303 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  50.17 
 
 
293 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  53.17 
 
 
293 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  48.43 
 
 
297 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  48.43 
 
 
297 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  48.43 
 
 
305 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  49.12 
 
 
305 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  48.12 
 
 
303 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  50.88 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  48.11 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  48.51 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  49.66 
 
 
294 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  48.01 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  49 
 
 
311 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  48.47 
 
 
307 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  46.73 
 
 
315 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  49.66 
 
 
302 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  46.71 
 
 
313 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  48.53 
 
 
313 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  51.06 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  44.77 
 
 
315 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  44.4 
 
 
289 aa  241  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  47.83 
 
 
310 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  49.12 
 
 
305 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  45.62 
 
 
375 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  49.12 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  49.12 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  48.16 
 
 
310 aa  238  9e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  47.88 
 
 
291 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  50.18 
 
 
285 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  44.83 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  46.92 
 
 
289 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2805  chromosome segregation DNA-binding protein  48.21 
 
 
284 aa  234  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.012977  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  45.26 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  46.64 
 
 
294 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  46.64 
 
 
294 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 
300 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  42.86 
 
 
289 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  44.93 
 
 
362 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  46.55 
 
 
303 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  43.25 
 
 
301 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.08 
 
 
331 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0050  parB-like partition protein  43.08 
 
 
331 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>