189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2512 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  100 
 
 
413 aa  839    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  64.11 
 
 
417 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  58.5 
 
 
417 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  50.38 
 
 
401 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  51.02 
 
 
406 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  48 
 
 
406 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  50.61 
 
 
429 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  49.75 
 
 
399 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 
429 aa  332  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  43.42 
 
 
399 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  45.01 
 
 
394 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  43.43 
 
 
396 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  45.94 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
404 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
376 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
360 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  29.55 
 
 
413 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
274 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
392 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
432 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.98 
 
 
421 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
403 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
402 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 
410 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.13 
 
 
414 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.12 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  26.45 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
411 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
399 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
399 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
417 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
417 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
409 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
405 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  20.43 
 
 
392 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  24.36 
 
 
402 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.69 
 
 
442 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  27.13 
 
 
405 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
405 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  31.86 
 
 
402 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 
388 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
405 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  26.76 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.01 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
456 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  20.61 
 
 
397 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  27.24 
 
 
394 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  26.27 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
703 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
433 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
994 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  24.76 
 
 
1119 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
389 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
1106 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  38.22 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
956 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  33.14 
 
 
700 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
406 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  31.61 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  37.41 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  31.33 
 
 
860 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
1340 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  29.89 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  36.52 
 
 
1837 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
691 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
691 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
535 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
902 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>