More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2486 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  47.34 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  47.34 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  43.11 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  45.88 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  43.11 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  46.75 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  46.71 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  45.45 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  46.11 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  45.45 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  44.91 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  44.91 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  44.44 
 
 		 204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  44.24 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  43.03 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  44.91 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  45.61 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  41.92 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  45.61 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  43.71 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  41.32 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  44.24 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  41.38 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  45.56 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  42.69 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  40.12 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  40.12 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  45.61 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.2 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.52 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.52 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  42.6 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  37.79 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  38.6 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  41.3 
 
 		 207 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  35.71 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  44.71 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  44.71 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  43.71 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.39 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  39.25 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  39.89 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  42.69 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  37.28 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  33.15 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  43.11 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  43.11 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.21 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  43.11 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  36.05 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  46.75 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  40.72 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  48.5 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  41.92 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  39.88 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  35.59 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  43.71 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  35.47 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  37.65 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  36.22 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.5 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  38.79 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  35.43 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  37.57 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  35.36 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  44.89 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.26 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  35.26 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  33.33 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2092  peptide deformylase  38.15 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  37.8 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  35.8 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  40.85 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  36.97 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  38.64 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.16 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.42 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  38.69 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  42.29 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  42.77 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  37.42 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  42.51 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  39.11 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  34.48 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  34.78 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  36.72 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.38 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  36.94 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  36.88 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>