More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2479 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2479  protease Do  100 
 
 
450 aa  873  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  63.66 
 
 
460 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  54.1 
 
 
465 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  57.85 
 
 
457 aa  454  1e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  49.78 
 
 
473 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  51.55 
 
 
449 aa  416  1e-115  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  51.1 
 
 
451 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  50.66 
 
 
450 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  51.71 
 
 
450 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  48.13 
 
 
459 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  49.34 
 
 
450 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  49.34 
 
 
450 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  5.15523e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  49.34 
 
 
450 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  50.11 
 
 
450 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.11786e-07  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.35 
 
 
451 aa  398  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  48.35 
 
 
450 aa  400  1e-110  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  49.12 
 
 
450 aa  400  1e-110  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  48.57 
 
 
450 aa  401  1e-110  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.80809e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  50.23 
 
 
455 aa  399  1e-110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  48.35 
 
 
450 aa  400  1e-110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  48.13 
 
 
450 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.86 
 
 
449 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  50.33 
 
 
458 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  48.85 
 
 
476 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  44.76 
 
 
458 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  49.08 
 
 
453 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  47.45 
 
 
446 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  48.17 
 
 
455 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  48.84 
 
 
456 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  48.39 
 
 
455 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  45.82 
 
 
455 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  48.88 
 
 
469 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  49.23 
 
 
456 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  45.82 
 
 
455 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  46.42 
 
 
456 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  45.82 
 
 
455 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  45.82 
 
 
455 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  45.12 
 
 
455 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  45.25 
 
 
451 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  46.32 
 
 
457 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  46.32 
 
 
457 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.01384e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  47.95 
 
 
456 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.01293e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  46.32 
 
 
463 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  46.41 
 
 
476 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  46.77 
 
 
496 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  48.42 
 
 
456 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  45.15 
 
 
455 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  45.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  45.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  45.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  45.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  45.6 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  45.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  47.89 
 
 
456 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  45.37 
 
 
455 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  44.93 
 
 
474 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  44.93 
 
 
474 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  47.86 
 
 
456 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  45.15 
 
 
474 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  44.69 
 
 
462 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  44.71 
 
 
474 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  49.44 
 
 
478 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  44.92 
 
 
478 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  44.92 
 
 
478 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  44.92 
 
 
475 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  44.92 
 
 
475 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  44.92 
 
 
475 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  45.07 
 
 
485 aa  357  2e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  44.14 
 
 
481 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  44.14 
 
 
481 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  43.97 
 
 
487 aa  353  3e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  44.14 
 
 
481 aa  353  3e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  55.29 
 
 
374 aa  352  6e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  46.83 
 
 
476 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  45.96 
 
 
482 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  49.29 
 
 
481 aa  346  5e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  42.24 
 
 
460 aa  345  1e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  48.54 
 
 
477 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  49.29 
 
 
481 aa  343  3e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  41.68 
 
 
451 aa  337  2e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  41.68 
 
 
451 aa  337  4e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  43.63 
 
 
506 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  54.63 
 
 
365 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  40.09 
 
 
472 aa  324  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.65 
 
 
513 aa  322  1e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42 
 
 
466 aa  320  4e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.88 
 
 
478 aa  319  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42 
 
 
466 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.59 
 
 
457 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.7 
 
 
476 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.29 
 
 
412 aa  314  3e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  53.42 
 
 
381 aa  312  6e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  43.65 
 
 
474 aa  312  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  43.65 
 
 
474 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>