242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2475 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  50.52 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  52.07 
 
 
288 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  50.17 
 
 
287 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  50.17 
 
 
287 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  49.48 
 
 
287 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  49.83 
 
 
287 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  49.83 
 
 
287 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  49.83 
 
 
287 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  47.42 
 
 
287 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  48.43 
 
 
287 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  47.08 
 
 
287 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  46.74 
 
 
287 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  45.83 
 
 
288 aa  255  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  50.17 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  48.43 
 
 
287 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  46.18 
 
 
288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  45.83 
 
 
287 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  45.83 
 
 
287 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  48.43 
 
 
287 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  45.83 
 
 
287 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  45.49 
 
 
287 aa  249  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  45.14 
 
 
288 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  45.49 
 
 
287 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  45.49 
 
 
287 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  46.05 
 
 
287 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  45.7 
 
 
287 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  46.74 
 
 
287 aa  247  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  47.42 
 
 
309 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  46.39 
 
 
287 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  44.79 
 
 
287 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  44.3 
 
 
287 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  46.05 
 
 
287 aa  244  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  47.77 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  45.36 
 
 
287 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  46.53 
 
 
287 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  43.06 
 
 
287 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  46.53 
 
 
287 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  47.62 
 
 
288 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  46.5 
 
 
285 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  43.06 
 
 
287 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  43.21 
 
 
287 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  42.71 
 
 
288 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  43.55 
 
 
287 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  43.9 
 
 
287 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  43.06 
 
 
288 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  41.67 
 
 
290 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  41.67 
 
 
287 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  41.67 
 
 
288 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  44.79 
 
 
287 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  41.32 
 
 
287 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  44.79 
 
 
287 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  45.99 
 
 
287 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  41.72 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  42.12 
 
 
288 aa  219  5e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  41.72 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  44.29 
 
 
289 aa  217  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  42.76 
 
 
287 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  43.84 
 
 
289 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  45.24 
 
 
293 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  42.36 
 
 
288 aa  198  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  42.18 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  37.98 
 
 
287 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  40.96 
 
 
300 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  41.72 
 
 
286 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  43.06 
 
 
282 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  41.36 
 
 
288 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  38.33 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  39.58 
 
 
288 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  41.36 
 
 
292 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  41.1 
 
 
291 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1528  hypothetical protein  37.29 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  35.12 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  42.12 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  35.12 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  41.86 
 
 
294 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  42.12 
 
 
291 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2441  hypothetical protein  39.8 
 
 
294 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000733927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2920  hypothetical protein  40.94 
 
 
296 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1564  hypothetical protein  40.94 
 
 
296 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  38.85 
 
 
294 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  38.8 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  42.03 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3480  hypothetical protein  38.38 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>