163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2356 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  70.07 
 
 		 149 aa  207  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  64.23 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  65.94 
 
 		 138 aa  200  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  65.94 
 
 		 154 aa  196  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  66.67 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  64.49 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  62.32 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  62.32 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  63.77 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  64.49 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  64.49 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  60.87 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  62.32 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  63.97 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  63.04 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  63.04 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  63.04 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  63.04 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  63.04 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  58.57 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  59.42 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  60.29 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  58.09 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  55.88 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  55.71 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  57.14 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  57.55 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  57.55 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  55.8 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  53.57 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  53.62 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  53.62 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  56.12 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  56.12 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  53.62 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  53.62 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  53.62 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  56.12 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  53.62 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  54.35 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  54.35 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  54.35 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  54.35 
 
 		 140 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  54.29 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  52.59 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  52.9 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  52.9 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  52.9 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  52.9 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  52.17 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  54.01 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  54.01 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  54.01 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  55.56 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  52.9 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  54.81 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  53.28 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  51.82 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  51.47 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  51.47 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  51.47 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  51.47 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  52.94 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  52.59 
 
 		 135 aa  146  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  50.74 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  50 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  49.32 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  53.24 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1064  OsmC family protein  53.62 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.156075  normal  0.0776132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  49.32 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  49.32 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  48.53 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  52.17 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  49.01 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  48.34 
 
 		 152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  49.32 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  51.45 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  48.32 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  47.97 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2326  OsmC family protein  49.64 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4022  OsmC-like protein  48.89 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  47.79 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1591  OsmC family protein  52.5 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277142  normal  0.616103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3415  OsmC family protein  50 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  44.85 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  45.19 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  43.38 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  39.71 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>