More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2327 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  100 
 
 
367 aa  743    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  56.75 
 
 
365 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  59.55 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  54.73 
 
 
363 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  52.15 
 
 
356 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  52.15 
 
 
356 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  50.14 
 
 
360 aa  360  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  48.99 
 
 
344 aa  358  9e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  49.03 
 
 
363 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  51.01 
 
 
360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
355 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
355 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  49.72 
 
 
380 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
355 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  46.72 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  46.18 
 
 
360 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  44.94 
 
 
376 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  47.41 
 
 
356 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  45.61 
 
 
369 aa  278  9e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  44.38 
 
 
360 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  42.5 
 
 
366 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  33.97 
 
 
357 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.78 
 
 
341 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  33.02 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  31.93 
 
 
351 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  33.84 
 
 
349 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 
357 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  34.23 
 
 
360 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 
358 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  31.1 
 
 
353 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  32.73 
 
 
351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  32.73 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  29.9 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  32.2 
 
 
350 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  31.4 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  32.92 
 
 
359 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  29.31 
 
 
418 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  31.68 
 
 
357 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
363 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
357 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  29.85 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  31.53 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
356 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.53 
 
 
351 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  28.7 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  33.23 
 
 
362 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
355 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.63 
 
 
343 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
416 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.82 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.19 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
263 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
263 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
263 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
285 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
285 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
285 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  31.62 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  35.24 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
263 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
263 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
226 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  30.2 
 
 
270 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.78 
 
 
779 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.17 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
264 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
272 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.06 
 
 
202 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.62 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  29.06 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  29.22 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
225 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  29.57 
 
 
242 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  29.06 
 
 
355 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.81 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0788  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
779 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.156743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.51 
 
 
223 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.22 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 
246 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>