More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2319 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  65.6 
 
 		 135 aa  173  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  65.08 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  60.31 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  62.4 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  61.79 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  60.77 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  58.46 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.02 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.29 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  60.66 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.25 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  58.2 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  61.16 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  64.23 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  61.6 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.6 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 132 aa  160  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  61.72 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  60.33 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  60.33 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  62.6 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  56 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  59.68 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  57.38 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  58.78 
 
 		 133 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  57.26 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  57.85 
 
 		 189 aa  154  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  56.14 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.96 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  56.2 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  56.1 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  59.66 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  56.45 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 290 aa  146  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  51.94 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  61.06 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  56.14 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.97 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  55.04 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  52.8 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>