24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2313 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  100 
 
 		 465 aa  956    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  69.89 
 
 		 474 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  56.61 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  47.58 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  47.52 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  46.73 
 
 		 482 aa  451  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  39.61 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03531  putative neutral invertase-like protein  37.26 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0333  putative neutral invertase-like protein  36.77 
 
 		 479 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03511  putative neutral invertase-like protein  36.83 
 
 		 479 aa  319  9e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268956  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  36.13 
 
 		 485 aa  318  9e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03591  putative neutral invertase-like protein  35.71 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.628204  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  35.7 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  35.7 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  35.91 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  37.87 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  34.87 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  33.55 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  22.14 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 698 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  32.7 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  33.33 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  29.01 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  28.24 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>