152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2299 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
328 aa  651    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  54.69 
 
 
358 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  49.33 
 
 
360 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
327 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  46 
 
 
328 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  40.11 
 
 
514 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  39.88 
 
 
529 aa  185  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  41.1 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  38.23 
 
 
513 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  37.92 
 
 
513 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 
331 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  37.22 
 
 
391 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  38.6 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  38.26 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  41.78 
 
 
323 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  37.95 
 
 
542 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  37.16 
 
 
540 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  36.1 
 
 
505 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  37.65 
 
 
549 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 
336 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  36.42 
 
 
341 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  37.95 
 
 
362 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 
357 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  37.94 
 
 
338 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
340 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  35.9 
 
 
506 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
346 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 
357 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  35.65 
 
 
509 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  37.35 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  36.47 
 
 
506 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
332 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 
365 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  36.96 
 
 
529 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  35.71 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  34.47 
 
 
509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  40.34 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 
349 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  37.09 
 
 
372 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  32.69 
 
 
562 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 
339 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
388 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  36.78 
 
 
523 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  36.26 
 
 
507 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 
427 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 
360 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  41.4 
 
 
341 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 
344 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  42.09 
 
 
472 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  32.39 
 
 
505 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  34.77 
 
 
504 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
333 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 
349 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  39.58 
 
 
401 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
384 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  39.35 
 
 
350 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
387 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  37.71 
 
 
341 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  36.78 
 
 
507 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 
349 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 
349 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
387 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 
341 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  38.02 
 
 
349 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  36.83 
 
 
349 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
368 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  37.06 
 
 
348 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  35.33 
 
 
505 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  36.68 
 
 
368 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  32.72 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  34.1 
 
 
498 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  35.88 
 
 
339 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  36.76 
 
 
340 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 
393 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 
344 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  37.95 
 
 
330 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  34.63 
 
 
523 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  32.12 
 
 
379 aa  153  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  32.4 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  31.79 
 
 
329 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  32.01 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  31.12 
 
 
351 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 
379 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  32.09 
 
 
325 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  30.03 
 
 
361 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  37.46 
 
 
401 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  33.75 
 
 
345 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  34.33 
 
 
339 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  37.16 
 
 
344 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
339 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
339 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  37.46 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  37.46 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  37.46 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  37.46 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  37.46 
 
 
344 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 
361 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>