More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2221 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  100 
 
 
372 aa  731    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  58.64 
 
 
385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.33 
 
 
385 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  50.53 
 
 
386 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  50.13 
 
 
386 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  50 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  50 
 
 
402 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.85 
 
 
412 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  52.98 
 
 
380 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  51.73 
 
 
386 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  53.37 
 
 
389 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  52.15 
 
 
389 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  51.73 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.68 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  51.33 
 
 
383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.61 
 
 
408 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  48.17 
 
 
407 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  47.52 
 
 
403 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.23 
 
 
398 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  48.03 
 
 
407 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.52 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  48.43 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  48.17 
 
 
404 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  47.27 
 
 
402 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  51.82 
 
 
392 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.88 
 
 
401 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.88 
 
 
401 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.88 
 
 
401 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.95 
 
 
417 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.61 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.61 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.61 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  45.65 
 
 
396 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.67 
 
 
396 aa  319  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  46.61 
 
 
402 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  50.27 
 
 
383 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  46.61 
 
 
402 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  46.37 
 
 
402 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  46.37 
 
 
402 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  46.37 
 
 
402 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.3 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  46.05 
 
 
383 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  46.79 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  46.76 
 
 
388 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.82 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.28 
 
 
380 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.61 
 
 
379 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  52.4 
 
 
386 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.99 
 
 
398 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.23 
 
 
388 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.21 
 
 
385 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  53.33 
 
 
386 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.64 
 
 
384 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  49.05 
 
 
383 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 
442 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  47.61 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  45.91 
 
 
442 aa  285  8e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  44.47 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  52.43 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  46.69 
 
 
350 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.96 
 
 
465 aa  275  9e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  45.15 
 
 
477 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.11 
 
 
478 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  44.78 
 
 
479 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.21 
 
 
391 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  45.71 
 
 
476 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.66 
 
 
513 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  45.71 
 
 
476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  47.06 
 
 
511 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.37 
 
 
474 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  43.92 
 
 
481 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  46.22 
 
 
457 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.1 
 
 
474 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.18 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  45.73 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  45.32 
 
 
482 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.4 
 
 
502 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.37 
 
 
479 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  40.74 
 
 
472 aa  262  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  43.67 
 
 
477 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.67 
 
 
492 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.98 
 
 
474 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  41.9 
 
 
472 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  47.77 
 
 
488 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.89 
 
 
471 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.67 
 
 
477 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  47.34 
 
 
485 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  47.48 
 
 
488 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  41.28 
 
 
472 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  41.28 
 
 
472 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.17 
 
 
478 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  47.09 
 
 
471 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 
476 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.89 
 
 
472 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  44.17 
 
 
504 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  46.32 
 
 
463 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.36 
 
 
502 aa  255  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  45.4 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  43.32 
 
 
481 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.47 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>