More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2189 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  43.46 
 
 
317 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.34 
 
 
313 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  42.67 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.5 
 
 
315 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.54 
 
 
314 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.87 
 
 
313 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  39.87 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  42.95 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.89 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.26 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.35 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  44.01 
 
 
322 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  39.43 
 
 
321 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  38.56 
 
 
314 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  41.61 
 
 
310 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.22 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.06 
 
 
312 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  36.22 
 
 
317 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  36.63 
 
 
314 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  38.89 
 
 
319 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  38.02 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  35.62 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  37.7 
 
 
320 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  37.58 
 
 
329 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  35.16 
 
 
314 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.16 
 
 
316 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.83 
 
 
316 aa  153  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.05 
 
 
329 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.05 
 
 
329 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
352 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  42.11 
 
 
194 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  40.84 
 
 
194 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  41.36 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  40.84 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  37.23 
 
 
198 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  50 
 
 
141 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  48.11 
 
 
142 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  40.3 
 
 
209 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  40.3 
 
 
209 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  40.3 
 
 
209 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  40.3 
 
 
209 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  40.31 
 
 
196 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  40.3 
 
 
209 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  47.79 
 
 
149 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
194 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
194 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 
194 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  46.9 
 
 
149 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  46.9 
 
 
149 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
147 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  46.9 
 
 
149 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  36.67 
 
 
132 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  36.67 
 
 
132 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  46.9 
 
 
149 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.66 
 
 
129 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 
149 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  35.83 
 
 
132 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
147 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
147 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  45.13 
 
 
147 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  46.02 
 
 
149 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  44.83 
 
 
149 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  40 
 
 
149 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  43.22 
 
 
153 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  49.04 
 
 
153 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  39.8 
 
 
196 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  46.02 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  39.8 
 
 
196 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  35.83 
 
 
130 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  49.04 
 
 
152 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  49.04 
 
 
152 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  40.91 
 
 
127 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  47.97 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.5 
 
 
129 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 
147 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 
199 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.17 
 
 
134 aa  96.3  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  37.5 
 
 
130 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  35.11 
 
 
212 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
138 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
128 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
147 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
128 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.33 
 
 
128 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  36.67 
 
 
130 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  26.07 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  36.67 
 
 
130 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  36.67 
 
 
130 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.02 
 
 
131 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
155 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
133 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
133 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
133 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
137 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
142 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  35.83 
 
 
134 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>