174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2025 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  56.21 
 
 
168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  51.55 
 
 
164 aa  168  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  46.91 
 
 
173 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  50.32 
 
 
188 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  51.08 
 
 
155 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  49.29 
 
 
149 aa  154  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  47.62 
 
 
159 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  51.32 
 
 
164 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  43.33 
 
 
164 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  46.36 
 
 
165 aa  150  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  48.61 
 
 
161 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000126595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  48.61 
 
 
161 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  48.61 
 
 
161 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  48.61 
 
 
161 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  48.32 
 
 
162 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  47.65 
 
 
163 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  43.67 
 
 
159 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  47.92 
 
 
161 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  44.08 
 
 
161 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  45.89 
 
 
160 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  48.97 
 
 
162 aa  147  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  42.94 
 
 
164 aa  147  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  45.64 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  42.28 
 
 
162 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  49.62 
 
 
154 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  42.69 
 
 
172 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  43.1 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  47.26 
 
 
152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  45.33 
 
 
156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  45.83 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 
157 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  44.72 
 
 
169 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000228873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  48.12 
 
 
161 aa  144  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  42.21 
 
 
161 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  40.94 
 
 
163 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  43.45 
 
 
156 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  43.15 
 
 
158 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  45.64 
 
 
161 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  45.64 
 
 
161 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  44.83 
 
 
162 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  44.83 
 
 
162 aa  141  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  46.05 
 
 
172 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  45.09 
 
 
169 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  46.05 
 
 
172 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  42.21 
 
 
161 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  44.44 
 
 
158 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  44.14 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  41.56 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  44.22 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  44.22 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2227  preprotein translocase subunit SecB  44.68 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0081632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  41.56 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  44.22 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  46.21 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  43.62 
 
 
157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  48.09 
 
 
164 aa  137  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  44.12 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  44.12 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  41.38 
 
 
161 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  44.94 
 
 
159 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000356209  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  42.14 
 
 
151 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  47.33 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  39.86 
 
 
148 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  43.71 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  40.41 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  43.7 
 
 
150 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  45.19 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  40.58 
 
 
152 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  41.22 
 
 
150 aa  130  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  45.7 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  42.96 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  42.75 
 
 
152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0041  preprotein translocase subunit SecB  42.96 
 
 
169 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  44.96 
 
 
149 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  44.96 
 
 
149 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  40.71 
 
 
160 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  42.11 
 
 
166 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  38.51 
 
 
156 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  39.35 
 
 
173 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  36.88 
 
 
159 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  36.88 
 
 
159 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  42.34 
 
 
171 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>