More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1980 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  56.57 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  57.36 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  50.6 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  51.57 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  51.57 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  52.53 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  50.39 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  50.39 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  56.57 
 
 		 265 aa  241  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  52.96 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  48.22 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 		 268 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  49.62 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  51.97 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  51.18 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  50.97 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2340  dimethyladenosine transferase  55.08 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1657  dimethyladenosine transferase  48.43 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  50.99 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  50.78 
 
 		 269 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  48.03 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  50.2 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  50.2 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  48.44 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0394  dimethyladenosine transferase  53.73 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  47.64 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0500  dimethyladenosine transferase  51.16 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  51.39 
 
 		 264 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  50.39 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0439  dimethyladenosine transferase  51.72 
 
 		 278 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  47.83 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  47.83 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  45.49 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  47.66 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0409  dimethyladenosine transferase  52.17 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.689254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  47.45 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  46.83 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  47.24 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  45.1 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0518  dimethyladenosine transferase  52.17 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  46.85 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  46.48 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  49.61 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  47.04 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  46.46 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  47.86 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  46.46 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  47.47 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  50 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  50.4 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  45.28 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  46.39 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  45.1 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  45.91 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  45.28 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  45.63 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  44.66 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2734  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0211  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0874  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  46.06 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2344  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4110  dimethyladenosine transferase  48.61 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  46.06 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  45.38 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2424  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  45.17 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  45.17 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  49.61 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0709  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.589315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  45.67 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  45.1 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0695  dimethyladenosine transferase  49.81 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  45.14 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  45.28 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  44.09 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  43.75 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4021  dimethyladenosine transferase  48.46 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00888486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2735  dimethyladenosine transferase  48.66 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.486994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0578  dimethyladenosine transferase  50.99 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3468  dimethyladenosine transferase  47.64 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2096  dimethyladenosine transferase  48.66 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2708  dimethyladenosine transferase  48.66 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  44.79 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  44.79 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  44.36 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00055  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3548  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0057  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3604  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  44.26 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0055  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.361541  normal  0.68578 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0057  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00054  hypothetical protein  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6033  dimethyladenosine transferase  48.22 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  43.97 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>