267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1905 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 163 aa  333  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  53.16 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 177 aa  147  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.62 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  46.2 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  51.28 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  37.74 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  50.38 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  49.62 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  37.11 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  49.62 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  36.48 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 167 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.28 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.75 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  50 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  47.95 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  47.06 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 160 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  45 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.73 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.13 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  45 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  48.94 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  44.71 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  44.24 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  46.84 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  47.37 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  39.24 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>