More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1903 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
271 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.99 
 
 
265 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.64 
 
 
270 aa  332  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.98 
 
 
262 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.74 
 
 
262 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.21 
 
 
261 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.16 
 
 
280 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.62 
 
 
267 aa  313  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.99 
 
 
266 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.21 
 
 
266 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.84 
 
 
265 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.85 
 
 
266 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.93 
 
 
268 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.93 
 
 
268 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.76 
 
 
248 aa  294  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.56 
 
 
268 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.62 
 
 
269 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.88 
 
 
270 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.88 
 
 
270 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.72 
 
 
275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.04 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.2 
 
 
271 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.25 
 
 
285 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.94 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.4 
 
 
256 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.96 
 
 
261 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.96 
 
 
261 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.6 
 
 
256 aa  278  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.75 
 
 
266 aa  278  5e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.93 
 
 
265 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.2 
 
 
267 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.98 
 
 
296 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.31 
 
 
263 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.72 
 
 
270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.76 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.85 
 
 
271 aa  268  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.76 
 
 
289 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.34 
 
 
261 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.64 
 
 
280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.91 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.67 
 
 
290 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.21 
 
 
267 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.25 
 
 
295 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.64 
 
 
283 aa  262  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.24 
 
 
268 aa  258  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
301 aa  257  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.66 
 
 
300 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.38 
 
 
274 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.98 
 
 
300 aa  255  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.83 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.73 
 
 
257 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.3 
 
 
303 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.78 
 
 
257 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.37 
 
 
283 aa  251  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.26 
 
 
263 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.46 
 
 
287 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.87 
 
 
270 aa  249  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.4 
 
 
260 aa  248  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
291 aa  248  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
290 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
290 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
290 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
268 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.87 
 
 
264 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
268 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
268 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.93 
 
 
290 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.76 
 
 
296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.15 
 
 
262 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.29 
 
 
269 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.86 
 
 
301 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.29 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.89 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.67 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.91 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.75 
 
 
287 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.51 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.78 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.78 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
296 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.07 
 
 
287 aa  242  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.4 
 
 
296 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>