234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1869 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  58.41 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  58.41 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  49.53 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  50.45 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  50.45 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  54.63 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  55.43 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  48.51 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  53.33 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  44.66 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  55.95 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  57.95 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  44.33 
 
 		 270 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  49.35 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.35 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  42.27 
 
 		 270 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  51.95 
 
 		 262 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 262 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  42.27 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  40.51 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  40.24 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  42.53 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  44.09 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  55.41 
 
 		 265 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  39.02 
 
 		 263 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  41.46 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  40.26 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  34.34 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  49.45 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  49.45 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  40 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  46.84 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  46.59 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  65.31 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  46.59 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  41.32 
 
 		 259 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 259 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  43.84 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  33.77 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  37.04 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  37.37 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  34.74 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  41.35 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  49.3 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  39.6 
 
 		 264 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  28.57 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  37.97 
 
 		 369 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 254 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45.07 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>