More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1856 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  100 
 
 
249 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  66.12 
 
 
247 aa  359  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  65.55 
 
 
242 aa  353  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.75 
 
 
243 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  66.94 
 
 
251 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  63.75 
 
 
243 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  64.32 
 
 
243 aa  350  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  63.75 
 
 
243 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  66.8 
 
 
248 aa  347  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  65.13 
 
 
242 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  66.67 
 
 
248 aa  345  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  65.83 
 
 
245 aa  342  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  64.58 
 
 
243 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  64.58 
 
 
243 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  64.05 
 
 
259 aa  340  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  64.75 
 
 
248 aa  340  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  63.64 
 
 
243 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  64.73 
 
 
246 aa  338  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  63.49 
 
 
242 aa  338  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  64.2 
 
 
247 aa  337  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  61.51 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  62.92 
 
 
245 aa  330  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  62.5 
 
 
243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  60.33 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  60.25 
 
 
247 aa  324  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  60.25 
 
 
247 aa  324  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  61.18 
 
 
238 aa  323  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  62.25 
 
 
249 aa  318  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  58.9 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  58.33 
 
 
247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  57.56 
 
 
190 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  57.99 
 
 
190 aa  194  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  55.36 
 
 
174 aa  191  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  55.69 
 
 
176 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  54.44 
 
 
190 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  52.05 
 
 
175 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.91 
 
 
175 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  52.54 
 
 
189 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  53.89 
 
 
189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  46.02 
 
 
179 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  47.06 
 
 
179 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  46.47 
 
 
181 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  48.5 
 
 
182 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  48.5 
 
 
182 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  48.98 
 
 
179 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  48.19 
 
 
175 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 
162 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  47.25 
 
 
233 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  48.41 
 
 
159 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  45.56 
 
 
188 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  48.05 
 
 
157 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  45.62 
 
 
160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.2 
 
 
167 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.86 
 
 
159 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  46.06 
 
 
163 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  43.86 
 
 
184 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  45.62 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  44.03 
 
 
162 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 
160 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  44.94 
 
 
160 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3732  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  45.57 
 
 
161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4075  peroxiredoxin-like protein  45 
 
 
161 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.896251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  53.08 
 
 
168 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  41.88 
 
 
161 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  42.5 
 
 
161 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  53.79 
 
 
168 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.67 
 
 
157 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.04 
 
 
158 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  41.4 
 
 
157 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  43.64 
 
 
166 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  42.68 
 
 
161 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 
168 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 
157 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  53.79 
 
 
166 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.25 
 
 
158 aa  131  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  42.77 
 
 
157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
157 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  41.77 
 
 
161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  43.31 
 
 
158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  54.62 
 
 
166 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  41.14 
 
 
178 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  54.62 
 
 
166 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50.76 
 
 
168 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  48.57 
 
 
192 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  42.41 
 
 
157 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  40.25 
 
 
157 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  44.65 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  40.76 
 
 
159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.83 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  47.86 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.14 
 
 
157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  40.25 
 
 
157 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  48.57 
 
 
169 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  49.29 
 
 
168 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  41.14 
 
 
161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  47.65 
 
 
169 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>