25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1815 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1815  PilT protein domain protein  100 
 
 
128 aa  246  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000000295608  hitchhiker  0.0000000000237096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0480  PilT protein domain protein  49.19 
 
 
141 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1407  PilT domain-containing protein  42.61 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.145227  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1203  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  36.54 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  41.76 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0241  PilT protein domain protein  40.21 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3783  hypothetical protein  34.48 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873007  decreased coverage  0.000213032 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.13 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  32.79 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  34.29 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7380  nucleic acid-binding protein  34.82 
 
 
130 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3053  PilT domain-containing protein  34.91 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207599  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0406  PilT domain-containing protein  30.19 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000610027  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  29.75 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6500  PilT domain-containing protein  34.55 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.741915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  37.5 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3012  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2905  hypothetical protein  29.66 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225441  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0355  PilT protein  35.35 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.922806  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3368  hypothetical protein  31.86 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0355482  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0669  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.961701 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2863  PilT domain-containing protein  35.4 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  27.17 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  30.85 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>