More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1643 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 351 aa  722    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  61.16 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.87 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  34.26 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  31.94 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  29.41 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.88 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  31.34 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.53 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.91 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 299 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.12 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  36.61 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.87 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.19 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 314 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.46 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  33.47 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.74 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  31.58 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  31.51 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  30.1 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  30.09 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  31.16 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  30.88 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  31.23 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  30.88 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  33.2 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  30.82 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  30.82 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  30.82 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  30.82 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  30.53 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  30.53 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  30.53 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>