145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1636 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  100 
 
 		 334 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  62.35 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  67.89 
 
 		 330 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  55.62 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  53.05 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  48.14 
 
 		 337 aa  299  6e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  46.25 
 
 		 332 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  47.42 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  43.25 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  41.38 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  44.51 
 
 		 326 aa  258  9e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  44.51 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  42.38 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  42.38 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  39.82 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  51.32 
 
 		 198 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  44.13 
 
 		 210 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  41.24 
 
 		 192 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  48.48 
 
 		 141 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  38.89 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  49.23 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7064  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.44 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  53.91 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  44.27 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  41.98 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  46.15 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  46.15 
 
 		 343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  52.38 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  45.31 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  42.52 
 
 		 344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  45.8 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  46.32 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  48.25 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  44.35 
 
 		 361 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  49.57 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  42.97 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1088  hypothetical protein  75.71 
 
 		 73 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  48.39 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  42.97 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  39.55 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  41.35 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  43.51 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2571  death-on-curing family protein  50.43 
 
 		 120 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.742905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  38.28 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  48.72 
 
 		 340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  45.76 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  44.36 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  35.97 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  40.32 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  40.31 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  49.11 
 
 		 144 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  39.84 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  48.15 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  37.01 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  39.23 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  39.1 
 
 		 352 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  38.93 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  42.74 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  38.58 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  38.93 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  39.69 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  41.96 
 
 		 135 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  42.31 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  45.9 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  37.12 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  42.86 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  42.86 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  35.43 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  41.09 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  41.03 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  40 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  34.65 
 
 		 341 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  34.38 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  39.05 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  40 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  41.9 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  40.31 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  35.48 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  38.52 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  38.1 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  37.61 
 
 		 126 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  36.44 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  39.13 
 
 		 127 aa  85.9  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  36 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0517  prophage maintenance system killer protein  50 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  53.12 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  30.69 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  42.17 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  41.89 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0291  death-on-curing family protein  51.56 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  35.29 
 
 		 105 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1861  death-on-curing family protein  48.53 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247149  hitchhiker  0.00267608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0599  death-on-curing family protein  46.55 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0600  death-on-curing family protein  41.56 
 
 		 138 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 164 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5367  death-on-curing family protein  42.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>