More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1579 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
432 aa  858    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  53.68 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  49.76 
 
 
424 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  48.81 
 
 
424 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  45.84 
 
 
426 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  44.73 
 
 
435 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  45.13 
 
 
423 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  46.27 
 
 
413 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  43.94 
 
 
433 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  47.54 
 
 
423 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  46.29 
 
 
427 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  47.37 
 
 
476 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  43.93 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  46.02 
 
 
416 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  41.98 
 
 
417 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  41.51 
 
 
417 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  45.71 
 
 
422 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  43.53 
 
 
426 aa  316  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  43.56 
 
 
427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  45.43 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  43.87 
 
 
425 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  42.32 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  36.79 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  36.41 
 
 
411 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  38.46 
 
 
414 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  41.29 
 
 
418 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  34.3 
 
 
409 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  34.3 
 
 
409 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  34.3 
 
 
409 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  36.38 
 
 
500 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  37.53 
 
 
442 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  33.41 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  38.01 
 
 
474 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  33.65 
 
 
485 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  35.22 
 
 
496 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  34.76 
 
 
492 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  32.25 
 
 
536 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.95 
 
 
501 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.07 
 
 
509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.09 
 
 
496 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.41 
 
 
512 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  28.51 
 
 
506 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  24.94 
 
 
500 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.07 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  25.21 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.49 
 
 
500 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.11 
 
 
511 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29 
 
 
510 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  26.61 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  30.49 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  27.91 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  30.07 
 
 
499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.11 
 
 
498 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  27.19 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.35 
 
 
515 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25.79 
 
 
489 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.26 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  31.32 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  25.17 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  25.17 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.39 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.39 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  26.91 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  26.5 
 
 
502 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  31.48 
 
 
502 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  22.49 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  27.95 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  28.42 
 
 
524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  28.25 
 
 
493 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  25.89 
 
 
483 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  26.49 
 
 
496 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  26.2 
 
 
489 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  27.31 
 
 
484 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  27.11 
 
 
493 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.16 
 
 
498 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  27.22 
 
 
532 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  26.54 
 
 
493 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.48 
 
 
506 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.57 
 
 
472 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  28.22 
 
 
510 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  30.29 
 
 
484 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  27.74 
 
 
483 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  27.35 
 
 
493 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  26.99 
 
 
493 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  27.35 
 
 
493 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  27.19 
 
 
493 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  25.98 
 
 
499 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0482  carbohydrate kinase FGGY  26.86 
 
 
474 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.652792  hitchhiker  0.00292056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  27.64 
 
 
493 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  27.17 
 
 
502 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  27 
 
 
505 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  26.56 
 
 
497 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  27.93 
 
 
508 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  26.7 
 
 
511 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  26.1 
 
 
499 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  22.3 
 
 
496 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  26.65 
 
 
490 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  26.97 
 
 
484 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  27.69 
 
 
487 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.68 
 
 
499 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>