170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1574 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  48.68 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  56.16 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  46.62 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  52.03 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  48.68 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  51.01 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  51.37 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  48.68 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  46.62 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  55.56 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  47.95 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  50.68 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  46.26 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  49.61 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  43.07 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  41.3 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.2 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  29.23 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.69 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  27.15 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  31.06 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  27.15 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  30.07 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  31.85 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  24.11 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  27.21 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  29.37 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  38.78 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  30.88 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.1 
 
 		 282 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  27.15 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.37 
 
 		 191 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  29.58 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  27.81 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  26.43 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  28.77 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  27.18 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  23.24 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  36.49 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.91 
 
 		 1345 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  28.24 
 
 		 236 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 230 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  29.89 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  28.46 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  29.41 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  27.52 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  34.57 
 
 		 1372 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.22 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  27.19 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  24.67 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  29.25 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  28.47 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  32.46 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  23.49 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  32.61 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5035  protein of unknown function DUF1568  21.92 
 
 		 214 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.916294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  23.65 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  24.24 
 
 		 304 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  30.53 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  27.59 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  27.97 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  24.49 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  23.23 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  24.71 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  21.77 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  26.62 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  32.69 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  36.21 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  29.01 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  32.69 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0242  protein of unknown function DUF1568  30.21 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  32.29 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  26.6 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  23.13 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  26.03 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  26.52 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2321  hypothetical protein  30.15 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0102584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  25.9 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  24.56 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>