18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1571 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1571  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 371 aa  750    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.647884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2110  hypothetical protein  28.88 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.730509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2366  lipopolysaccharide biosynthesis  25.98 
 
 		 518 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.4 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  21.28 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  42.59 
 
 		 740 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  40.74 
 
 		 740 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0074  chain length determinant family protein  36.07 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  40.74 
 
 		 753 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.07 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.853299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0357  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.55 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  39.06 
 
 		 757 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  35.71 
 
 		 716 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  25.96 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  33.93 
 
 		 747 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>