24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1570 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1570  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0758  MarR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.663702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2316  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0798  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1236  hypothetical protein  48.54 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.82618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0358  transcriptional regulator, MarR family  46.6 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1145  hypothetical protein  50.96 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0077  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0075  hypothetical protein  45.19 
 
 		 119 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.492239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0756  MarR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.58096  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1794  AsnC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  38.95 
 
 		 691 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0625  hypothetical protein  45.07 
 
 		 212 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3791  regulatory protein, MarR  46.27 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1123  hypothetical protein  39.02 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0892  hypothetical protein  39.02 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.656766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2889  hypothetical protein  49.23 
 
 		 202 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0208213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3448  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3514  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000874673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  36.84 
 
 		 690 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1291  regulatory protein MarR  32.89 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2752  regulatory protein, MarR  39.22 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0934  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>