More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1552 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
230 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  92.61 
 
 
230 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  92.61 
 
 
230 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  92.2 
 
 
230 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  66.87 
 
 
165 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  42.92 
 
 
232 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  44.05 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  38.94 
 
 
231 aa  179  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  40.27 
 
 
228 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  40.43 
 
 
234 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  39.29 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  38.43 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  39.82 
 
 
230 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  46.01 
 
 
216 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  38.05 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  35.09 
 
 
232 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  34.96 
 
 
231 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  37.99 
 
 
233 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  38.05 
 
 
234 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  37.44 
 
 
255 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  38.5 
 
 
239 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  37.33 
 
 
226 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  35.24 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  35.24 
 
 
250 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  35.68 
 
 
241 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  36.73 
 
 
234 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  34.78 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  34.78 
 
 
235 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40.97 
 
 
235 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  34.35 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  33.91 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  33.48 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  34.35 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  35.84 
 
 
236 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.61 
 
 
222 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  32.89 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.93 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  33.63 
 
 
224 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  31.58 
 
 
316 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  37.91 
 
 
226 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  36.28 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  45.52 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  35.09 
 
 
221 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  33.19 
 
 
261 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  33.63 
 
 
247 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.18 
 
 
321 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  36.31 
 
 
253 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.5 
 
 
318 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  36.46 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  34.06 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  35.75 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.65 
 
 
314 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  33.19 
 
 
235 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  27.43 
 
 
461 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  33.65 
 
 
322 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33.62 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.91 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  31.42 
 
 
221 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  37.16 
 
 
250 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  38.26 
 
 
251 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  27.95 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  32.06 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  33.49 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  31.31 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  31.36 
 
 
288 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  35.57 
 
 
258 aa  109  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  32.82 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.7 
 
 
181 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.55 
 
 
323 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  40.44 
 
 
241 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.86 
 
 
312 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  32.49 
 
 
319 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  33.51 
 
 
190 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  31.16 
 
 
289 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  35.96 
 
 
304 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  33.51 
 
 
192 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  28.95 
 
 
326 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  28.09 
 
 
238 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  40.46 
 
 
236 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  36.05 
 
 
245 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  38.17 
 
 
236 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  29.44 
 
 
287 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  35.38 
 
 
325 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  35.33 
 
 
277 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>