54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1500 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
253 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  44.25 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  43.81 
 
 
235 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  43.81 
 
 
235 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  42.08 
 
 
229 aa  185  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  38.33 
 
 
248 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  28.84 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  25.48 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  22.95 
 
 
575 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  31.88 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  27.41 
 
 
385 aa  59.3  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  28.22 
 
 
363 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  31.54 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  32.33 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0872  OmpA/MotB  25.12 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178766  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  32.33 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  29.49 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2959  hypothetical protein  29.2 
 
 
450 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.775689  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  28.1 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  29.85 
 
 
466 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.31 
 
 
510 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  26.92 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  26.79 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  29.93 
 
 
377 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.49 
 
 
259 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  31.58 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 
333 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  26.92 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.05 
 
 
452 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  29.1 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  29.88 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  29.03 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  29.49 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  33.08 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 
468 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  27.27 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  29.55 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  26.58 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  30.77 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  28.12 
 
 
466 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  24.84 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 
642 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  32.99 
 
 
658 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  30.77 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  27.59 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  32.31 
 
 
1755 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  26.62 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
459 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
314 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  29.85 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 
540 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>