More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1496 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  69.28 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  64.51 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  61.94 
 
 		 291 aa  359  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  60.9 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  61.3 
 
 		 292 aa  351  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  59.39 
 
 		 294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  56.94 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  56.6 
 
 		 292 aa  329  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  56.55 
 
 		 302 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  56.94 
 
 		 285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  56.84 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  56.75 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  55.04 
 
 		 292 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  56.25 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  52.25 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  55.02 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  52.45 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  53.24 
 
 		 292 aa  286  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  54.67 
 
 		 292 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  53.41 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  52.7 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  52.7 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  52.98 
 
 		 294 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  52.1 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  53.5 
 
 		 294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  50.85 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  49.48 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  49.48 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  51.05 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  50.72 
 
 		 290 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.25 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  53.26 
 
 		 292 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  49.28 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  48.91 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  51.61 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  50 
 
 		 293 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  51.58 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  50 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  50 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 294 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  47.83 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  47.46 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  48.55 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  49.31 
 
 		 287 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  48.19 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  49.83 
 
 		 282 aa  261  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  49.28 
 
 		 294 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  51.02 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  52.8 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  51.19 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  49.28 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  50.72 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  50.68 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.98 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  50.68 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  50.68 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  50 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  50.18 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  51.25 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  48.46 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  50 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>