268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1380 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 		 493 aa  998    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  47.28 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.67 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.76 
 
 		 472 aa  289  6e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.27 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  39.29 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.74 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.85 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.8 
 
 		 484 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  38.91 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.96 
 
 		 484 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.5 
 
 		 482 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.1 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.73 
 
 		 484 aa  263  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.98 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.31 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.12 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.95 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.02 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.47 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.47 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.47 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.47 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 		 484 aa  256  8e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.02 
 
 		 482 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.63 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.6 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 		 484 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.6 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.6 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.32 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.39 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.39 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.82 
 
 		 482 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.58 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.46 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.54 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.75 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.12 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  33.12 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.12 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.12 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.12 
 
 		 482 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  34.1 
 
 		 484 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.68 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.91 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.26 
 
 		 484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.7 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.07 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.21 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.87 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.38 
 
 		 496 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.7 
 
 		 482 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.05 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.58 
 
 		 484 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  38.42 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.08 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.26 
 
 		 478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.08 
 
 		 482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.78 
 
 		 515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.87 
 
 		 484 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.87 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  31.58 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.75 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.91 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.4 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.7 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.61 
 
 		 370 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.51 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.71 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.77 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.6 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0130  thiamine biosynthesis protein ThiI  30.43 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00491755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  32.04 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  33.24 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.83 
 
 		 429 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0990  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.71 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0024577  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  32.01 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  39.78 
 
 		 414 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  34.15 
 
 		 392 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0763  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.6 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00421556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  34.37 
 
 		 400 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1140  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.44 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.69 
 
 		 383 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2307  thiamine biosynthesis protein  33.25 
 
 		 395 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0561858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.91 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  32.97 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.05 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0512  thiamine biosynthesis protein  32.74 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.05 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.29 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2301  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.16 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>