299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1325 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  100 
 
 
680 aa  1351    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  42.32 
 
 
662 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  38.33 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  36.95 
 
 
653 aa  360  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  38.29 
 
 
656 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  38.96 
 
 
705 aa  347  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2074  transglutaminase domain protein  36.65 
 
 
645 aa  320  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.618768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02438  hypothetical protein  36.62 
 
 
635 aa  317  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2250  transglutaminase-like domain protein  34.28 
 
 
641 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  38.1 
 
 
671 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1217  transglutaminase domain-containing protein  34.08 
 
 
689 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.64 
 
 
661 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26930  transglutaminase-like domain-containing protein  35.52 
 
 
668 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3379  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 
673 aa  290  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  30.93 
 
 
683 aa  287  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2531  transglutaminase-like  34.39 
 
 
673 aa  286  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1243  hypothetical protein  36.73 
 
 
698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0187404  normal  0.138058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  37.2 
 
 
676 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  34.31 
 
 
681 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1118  transglutaminase domain-containing protein  34.59 
 
 
685 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1212  hypothetical protein  34.59 
 
 
685 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.558928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2055  transglutaminase-like  33.33 
 
 
669 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2161  transglutaminase domain-containing protein  35.81 
 
 
684 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0907066  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  32.12 
 
 
767 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  32.08 
 
 
767 aa  275  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  40.25 
 
 
672 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  35.74 
 
 
668 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  35.39 
 
 
688 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2384  transglutaminase domain-containing protein  35.8 
 
 
726 aa  268  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  35.23 
 
 
688 aa  267  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  34.96 
 
 
649 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  36.62 
 
 
943 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2281  transglutaminase family protein  34.47 
 
 
662 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3148  transglutaminase-like  34.05 
 
 
676 aa  263  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442197 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  34.58 
 
 
674 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  34.58 
 
 
674 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  30.25 
 
 
667 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2914  transglutaminase domain-containing protein  37.23 
 
 
706 aa  253  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2532  transglutaminase domain-containing protein  29.47 
 
 
691 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  33.71 
 
 
667 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  29.19 
 
 
732 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1575  transglutaminase domain-containing protein  32.07 
 
 
696 aa  247  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
680 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  30.04 
 
 
689 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  29.1 
 
 
689 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1965  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 
674 aa  241  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  29.27 
 
 
707 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1864  hypothetical protein  27.01 
 
 
662 aa  237  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1873  hypothetical protein  27.36 
 
 
662 aa  233  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  28.43 
 
 
734 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  29.07 
 
 
734 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2098  transglutaminase domain-containing protein  35.64 
 
 
685 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  29.64 
 
 
709 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  29.3 
 
 
715 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 
715 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2368  transglutaminase domain-containing protein  29.04 
 
 
660 aa  224  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.34384  normal  0.577646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  28.09 
 
 
754 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  28.76 
 
 
715 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  31.05 
 
 
730 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  27.85 
 
 
739 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  27.85 
 
 
739 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0821  transglutaminase domain-containing protein  27.87 
 
 
692 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02557  transglutaminase family protein  26.77 
 
 
687 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1521  transglutaminase domain protein  25.37 
 
 
631 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2042  transglutaminase domain protein  27.57 
 
 
633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3275  transglutaminase domain-containing protein  25.41 
 
 
634 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.574729  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 
632 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1634  transglutaminase-like  27.96 
 
 
644 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000638598  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  27.86 
 
 
632 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  26.31 
 
 
730 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  28.47 
 
 
639 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.79 
 
 
644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.67 
 
 
744 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  26.56 
 
 
634 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1490  transglutaminase domain protein  25.25 
 
 
637 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  32.21 
 
 
737 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4603  transglutaminase domain-containing protein  25.59 
 
 
764 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 
763 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  28.1 
 
 
790 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  33.59 
 
 
706 aa  97.8  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  30 
 
 
774 aa  97.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
806 aa  97.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  25.09 
 
 
742 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  29.55 
 
 
886 aa  91.3  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  30.49 
 
 
800 aa  90.9  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  50.53 
 
 
673 aa  90.5  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  29.9 
 
 
812 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  42 
 
 
681 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.91 
 
 
825 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 
728 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  24.55 
 
 
742 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2905  transglutaminase domain protein  25.86 
 
 
769 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.74 
 
 
771 aa  87.8  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  24.91 
 
 
742 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  24.64 
 
 
742 aa  87  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 
720 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  24.55 
 
 
742 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  41.67 
 
 
788 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  24.55 
 
 
742 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  25.44 
 
 
840 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>