88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1136 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 682 aa  1399    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  74.23 
 
 		 682 aa  1078    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  78.5 
 
 		 681 aa  1147    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  68.04 
 
 		 682 aa  979    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  65.35 
 
 		 684 aa  961    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  60.03 
 
 		 681 aa  875    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  40.27 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  39.91 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  39.52 
 
 		 676 aa  492  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  39.59 
 
 		 687 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  39.34 
 
 		 679 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  38.53 
 
 		 678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  37.15 
 
 		 679 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  36.79 
 
 		 684 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  38.11 
 
 		 676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  36.54 
 
 		 678 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  36.08 
 
 		 676 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  35.33 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  39.7 
 
 		 703 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  36.77 
 
 		 686 aa  348  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  39 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  38.43 
 
 		 694 aa  327  6e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  39.21 
 
 		 675 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  34.71 
 
 		 531 aa  249  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.94 
 
 		 508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 		 470 aa  201  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.02 
 
 		 477 aa  198  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  36.33 
 
 		 485 aa  171  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  29.41 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  28.01 
 
 		 485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  26.99 
 
 		 186 aa  77  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  31.11 
 
 		 786 aa  63.9  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 		 823 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 801 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  27.84 
 
 		 856 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  28.96 
 
 		 809 aa  54.3  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 804 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  25.84 
 
 		 788 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 		 810 aa  53.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  25.84 
 
 		 788 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  28.92 
 
 		 803 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 		 811 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  26.96 
 
 		 775 aa  50.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 797 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 		 820 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  24.32 
 
 		 807 aa  48.9  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  27.01 
 
 		 817 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 816 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 815 aa  47.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  25.71 
 
 		 793 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  24.85 
 
 		 802 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  28.11 
 
 		 817 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  27.98 
 
 		 823 aa  47  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  26.37 
 
 		 772 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  27.98 
 
 		 823 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  22.07 
 
 		 797 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  24.24 
 
 		 825 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  25.11 
 
 		 840 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  24.74 
 
 		 801 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  25.67 
 
 		 780 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  25.29 
 
 		 774 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  24.14 
 
 		 798 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  22.99 
 
 		 793 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  25.68 
 
 		 823 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  25.29 
 
 		 898 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  23.7 
 
 		 932 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  26.4 
 
 		 790 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3752  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 803 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.728517  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  26.95 
 
 		 802 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 		 835 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  24.77 
 
 		 835 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  23.33 
 
 		 808 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  24.3 
 
 		 812 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 804 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  27.47 
 
 		 790 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  24.71 
 
 		 778 aa  44.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  25.2 
 
 		 558 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  27.57 
 
 		 792 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 799 aa  44.3  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  24.37 
 
 		 810 aa  44.3  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  25.45 
 
 		 880 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.35 
 
 		 781 aa  43.9  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  23.35 
 
 		 805 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  26.35 
 
 		 785 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  24.5 
 
 		 820 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.06 
 
 		 785 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>