More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1041 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  100 
 
 
106 aa  222  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1035  Rhodanese domain protein  80.19 
 
 
106 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  57.55 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  56.07 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  56.6 
 
 
105 aa  120  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  55.14 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  55.14 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0881  rhodanese domain-containing protein  53.27 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0432  rhodanese-like protein  53.27 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  53.27 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  54.21 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2480  rhodanese domain-containing protein  53.27 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  53.27 
 
 
107 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  54.21 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2568  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  50.47 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2045  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.550294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3125  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3064  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3100  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  51.4 
 
 
107 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0788  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0799  rhodanese domain-containing protein  51.4 
 
 
107 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0735  rhodanese-like domain-containing protein  50.47 
 
 
107 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0696  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.014224  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2174  rhodanese-like domain-containing protein  50.47 
 
 
107 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0605  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 
110 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415478  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 
377 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2282  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  52.33 
 
 
109 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595015  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.62 
 
 
393 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3957  rhodanese domain-containing protein  46.49 
 
 
115 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.998099  normal  0.190366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0646  Rhodanese domain protein  50 
 
 
110 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.126659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3722  Rhodanese domain protein  47.71 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1665  rhodanese-like protein  50.5 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2710  rhodanese-like protein  48.6 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.4 
 
 
379 aa  95.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2603  rhodanese-like protein  48.18 
 
 
113 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1127  rhodanese domain-containing protein  51.58 
 
 
121 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2351  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
111 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1161  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 
115 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2817  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0255311  normal  0.567823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1836  Rhodanese domain protein  43.12 
 
 
112 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.324614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.72 
 
 
375 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2027  rhodanese domain-containing protein  43.12 
 
 
112 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.168756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.23 
 
 
383 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  44.23 
 
 
392 aa  87  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.81 
 
 
383 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  50.65 
 
 
145 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.75 
 
 
390 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.27 
 
 
383 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  41.35 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1662  rhodanese-like protein  40.71 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0528375  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.05 
 
 
392 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.45 
 
 
395 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.21 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.57 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0876  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0902  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  49.35 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2438  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.517598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.38 
 
 
390 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.05 
 
 
397 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.9 
 
 
398 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.32 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.99 
 
 
390 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.98 
 
 
399 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  43.02 
 
 
377 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  47.5 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  43.62 
 
 
389 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.05 
 
 
392 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  37.5 
 
 
393 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 
396 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40 
 
 
400 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.95 
 
 
400 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.95 
 
 
400 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
461 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.53 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  37.84 
 
 
423 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.23 
 
 
393 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
395 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.05 
 
 
386 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0615  rhodanese-like protein  40.45 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 
386 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>