252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1033 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 333 aa  675    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  57.47 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  57.69 
 
 		 314 aa  332  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  53.55 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  45.6 
 
 		 637 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  44.01 
 
 		 644 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  32.87 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.91 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.5 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  25.57 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.35 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.06 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.84 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.79 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.75 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  21.98 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.6 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.93 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.93 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  39.08 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.17 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  35.05 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  23.38 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  29.76 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  25.36 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  23.58 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  22.37 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.87 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.07 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  21.83 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  22.27 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  29.71 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25.77 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>