253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1011 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
432 aa  880    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  54.4 
 
 
437 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.95 
 
 
447 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  50.23 
 
 
432 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.62 
 
 
435 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.38 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  48.28 
 
 
438 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.77 
 
 
433 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  50.25 
 
 
438 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  51.75 
 
 
438 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.5 
 
 
440 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  49.75 
 
 
438 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  47.07 
 
 
436 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  44.91 
 
 
444 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.83 
 
 
437 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.68 
 
 
432 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  40.67 
 
 
452 aa  310  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.25 
 
 
441 aa  302  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 
468 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
440 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 
443 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  42.41 
 
 
433 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.79 
 
 
444 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 
454 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  42 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  39.17 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  39.71 
 
 
457 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  39.71 
 
 
457 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  35.4 
 
 
430 aa  272  9e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 
444 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  43.19 
 
 
442 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 
472 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  39.34 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  41.15 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  38.98 
 
 
464 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  42.93 
 
 
462 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  42.68 
 
 
455 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.62 
 
 
453 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.26 
 
 
432 aa  247  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  39.46 
 
 
461 aa  246  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.89 
 
 
472 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  38.76 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.76 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.76 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.38 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
474 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 
481 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  32.3 
 
 
431 aa  196  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.78 
 
 
431 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 
425 aa  186  8e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
445 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.04 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  29.34 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 
490 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  29.34 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  29.34 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  29.34 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  29.34 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  28.74 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  28.14 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.54 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  26.95 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.47 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  31.33 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  26.29 
 
 
761 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.91 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  29.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.65 
 
 
473 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.22 
 
 
466 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  26.22 
 
 
466 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.85 
 
 
432 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  30.71 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.24 
 
 
485 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28.99 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.67 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  33.94 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  29.53 
 
 
495 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  26.67 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.71 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.45 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  31.39 
 
 
437 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.4 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  28.1 
 
 
1018 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0186702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  28.1 
 
 
1018 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  28.1 
 
 
1018 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.19 
 
 
476 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  28.1 
 
 
1018 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 
1018 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  30.71 
 
 
459 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>