More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0995 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  100 
 
 		 434 aa  907    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  83.33 
 
 		 431 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  64.9 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  64.2 
 
 		 434 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  63.59 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  63.59 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  63.98 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  64.8 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  64.1 
 
 		 430 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  64.34 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  63.97 
 
 		 429 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  64.2 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  63.97 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  64.61 
 
 		 436 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  64.81 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  63.07 
 
 		 433 aa  591  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  65.78 
 
 		 424 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  61.78 
 
 		 435 aa  589  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  64.25 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  63.13 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  64.45 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  64.35 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  64.85 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  65.48 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  62.27 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  63.9 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  64.44 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  63.34 
 
 		 437 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  62.06 
 
 		 438 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  63.18 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  62.79 
 
 		 430 aa  584  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  62.3 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  62.44 
 
 		 432 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  65.4 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  64.44 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  63.02 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  62.21 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  61.75 
 
 		 433 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  62.12 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  62.68 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  62.82 
 
 		 434 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  63.72 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  63.48 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  63.96 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  63.72 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  61.29 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  63.38 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  62.12 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  62.12 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  61.52 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  61.66 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  61.29 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  61.66 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  61.06 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  65.3 
 
 		 436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  63.96 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  64.2 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  63.72 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  63.96 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  63.18 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  61.86 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  64.2 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  61.02 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  63.72 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  60.83 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  63.48 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  61.75 
 
 		 433 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  62.15 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  62.71 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  65.24 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  61.02 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  65.24 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  60.83 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  63.48 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  63.68 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  63.68 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  64.76 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  63.68 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  63.68 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  64 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  62.14 
 
 		 425 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  63.18 
 
 		 446 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  63.25 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  63.49 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  65.71 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  65 
 
 		 428 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  60.14 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  60.6 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  63.49 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  63.49 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  60.55 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  60.79 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  60.14 
 
 		 433 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>