101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0969 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  67.09 
 
 
159 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  58.93 
 
 
190 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  60.59 
 
 
179 aa  203  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  56.98 
 
 
208 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  56.18 
 
 
180 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  56.4 
 
 
177 aa  201  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  56.47 
 
 
176 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  55.88 
 
 
185 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  54.12 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  54.71 
 
 
185 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  53.85 
 
 
185 aa  177  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  48.63 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  48.09 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  47.54 
 
 
183 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  50.89 
 
 
187 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  38.51 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  32.88 
 
 
145 aa  88.6  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  40.52 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  39.52 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  39.64 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  39.02 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  41.05 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.65 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  32.32 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  43.22 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  41.53 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  34.09 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  40.38 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  40.38 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  40.38 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  37.39 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  37.82 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  35.65 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.1 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  30.77 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  37.82 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  32.64 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  32.64 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  34.51 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  35.9 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  32.64 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  32.64 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  32.64 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  31.72 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.33 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  33.91 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  30.89 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  33.04 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  38.3 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  32.12 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.47 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.55 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  31.93 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  37.61 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  28.46 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.27 
 
 
145 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  34.26 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  31.09 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  25.42 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  27.59 
 
 
151 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  34.21 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.76 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  30.17 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  30.83 
 
 
132 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.51 
 
 
412 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  30.51 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  30.51 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  25.61 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  29.17 
 
 
407 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.34 
 
 
406 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.43 
 
 
406 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  29.87 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  27.97 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  32.28 
 
 
135 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  27.19 
 
 
405 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.97 
 
 
130 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.81 
 
 
130 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  28.79 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  31.3 
 
 
407 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  27.97 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  27.97 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  29.93 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  27.43 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2265  OsmC-like protein  32.29 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  27.56 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25.89 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25.89 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25.89 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  29.03 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  27.97 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  32.2 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  30.83 
 
 
131 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  28.05 
 
 
188 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  28.3 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1686  OsmC family protein  31.25 
 
 
141 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  30.93 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  38.78 
 
 
135 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>