195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0911 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 330 aa  672    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  61.72 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  50.53 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  37.54 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 438 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  32.04 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  31.07 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  31.86 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.71 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  34.28 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  24.83 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.72 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  29.3 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.04 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.58 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  25.99 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  26.27 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.53 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.74 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 		 351 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.55 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.76 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  23.72 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.69 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.61 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.62 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.18 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.38 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.95 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.78 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  25.83 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.81 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.81 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  25.28 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.24 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1104  beta-lactamase domain protein  32.12 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  24.05 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  25.42 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>