More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0885 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  57.14 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  46.4 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  43.2 
 
 		 270 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.48 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.1 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  54.44 
 
 		 121 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  44.35 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  38.4 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.63 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  46.6 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.86 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.31 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  47.13 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  44.25 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  35.94 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.46 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.87 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  43.48 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  43.62 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  45.38 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  35.43 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.83 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.17 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.5 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.17 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  41.59 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.29 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  41.73 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.66 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.6 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.36 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.67 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.35 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.33 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  43.56 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  37.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.83 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  44.23 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.05 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.94 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.83 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.8 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  37.25 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>