More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0777 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  100 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  58.91 
 
 
310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  52.45 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  51.84 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  50.56 
 
 
305 aa  299  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  50.88 
 
 
311 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  48.66 
 
 
277 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
312 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
302 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  44.36 
 
 
301 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  40 
 
 
309 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  43.56 
 
 
271 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  42.49 
 
 
314 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  40.96 
 
 
333 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40.53 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
316 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
323 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  41.98 
 
 
307 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  41.79 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  40.45 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  38.38 
 
 
302 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
304 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  38.52 
 
 
308 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
309 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
317 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
301 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  38.15 
 
 
307 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
272 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
303 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  36.57 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  36.09 
 
 
303 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  33.47 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  30.52 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  28.51 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  24.72 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  25.24 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  26.8 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  27.1 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  29.58 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  22.22 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  30.64 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.45 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.08 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  24.77 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  24.62 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.11 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  26.95 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  25.7 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.7 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  23.84 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  25.7 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  23.92 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  27.83 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  24.92 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  27.78 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  27.8 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  24.6 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2706  aldo/keto reductase  24.51 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.315446  normal  0.0513811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  24.58 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  33.18 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  25.93 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  25.28 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.71 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.7 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.31 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  23.38 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.64 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  26.9 
 
 
338 aa  65.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  23.59 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  23.59 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  26.39 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  27.86 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  27.99 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  23.48 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  26.77 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  31.02 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  29.24 
 
 
342 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  26.49 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  23.59 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  24.53 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  25.42 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  24.43 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  23.99 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.39 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>