260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0764 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  100 
 
 
452 aa  899    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2655  ribonuclease BN  61.48 
 
 
439 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3053  putative ribonuclease BN  50.73 
 
 
451 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  44.02 
 
 
447 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0931  putative ribonuclease BN  40.91 
 
 
459 aa  325  9e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.810596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2157  ribonuclease BN, putative  45.5 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  41.04 
 
 
422 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  35.77 
 
 
453 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1514  ribonuclease BN  39.78 
 
 
472 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.258349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  37.5 
 
 
397 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  36.29 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  36.04 
 
 
446 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  34.01 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  35.73 
 
 
479 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  34.26 
 
 
417 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  31.25 
 
 
442 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  32.49 
 
 
425 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4086  putative ribonuclease BN  32.75 
 
 
487 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  32.68 
 
 
450 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3064  ribonuclease BN, putative  34.9 
 
 
473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00183316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  29.51 
 
 
499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0739  putative ribonuclease BN  31.14 
 
 
434 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2681  ribonuclease BN  30.95 
 
 
561 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.267088 
 
 
-
 
NC_002950  PG0958  ribonuclease BN, putative  28.33 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.107096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  31.59 
 
 
337 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  35.52 
 
 
337 aa  147  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  35.52 
 
 
337 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  35.38 
 
 
320 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0595  ribonuclease BN  30.07 
 
 
460 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  35.03 
 
 
295 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  35.5 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  32.87 
 
 
336 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  34.51 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  34.98 
 
 
298 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  33.78 
 
 
451 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  30.79 
 
 
439 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  33.79 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  33.79 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  33.79 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  33.79 
 
 
323 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  30.54 
 
 
439 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  35.36 
 
 
340 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  30.05 
 
 
429 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  26.01 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  35.16 
 
 
310 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  33.22 
 
 
442 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  32.36 
 
 
443 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  32.36 
 
 
443 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 
437 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  31.75 
 
 
437 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  31.75 
 
 
437 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 
437 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  31.75 
 
 
437 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  32 
 
 
443 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  32.86 
 
 
442 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  35.63 
 
 
303 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  32.86 
 
 
442 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  35.94 
 
 
294 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  31.75 
 
 
437 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  31.5 
 
 
447 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.64 
 
 
405 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  31.44 
 
 
436 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  32.56 
 
 
437 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0732  ribonuclease BN  24.92 
 
 
424 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  32.16 
 
 
439 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  31.75 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  31.75 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2958  ribonuclease BN  36.23 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  31.39 
 
 
442 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  32.17 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  31.47 
 
 
297 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  27.91 
 
 
411 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  31.25 
 
 
294 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  30.2 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  28.85 
 
 
538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  35.39 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  30.2 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  33.33 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  33.33 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  27.43 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  33.33 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  33.33 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  33.33 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  28.01 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  27.92 
 
 
525 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  29.79 
 
 
427 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  27.92 
 
 
525 aa  113  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  31.72 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  30.47 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  31.76 
 
 
441 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.837363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  30.8 
 
 
296 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  31.76 
 
 
290 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>