More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0673 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  55.26 
 
 		 620 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 602 aa  1229    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  61.42 
 
 		 605 aa  738    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  52.17 
 
 		 601 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  55.52 
 
 		 602 aa  621  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  49.11 
 
 		 663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  46.38 
 
 		 645 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.33 
 
 		 614 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 616 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  46.06 
 
 		 609 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  46.15 
 
 		 609 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  48.47 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 647 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 633 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 612 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 607 aa  364  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.93 
 
 		 610 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 598 aa  357  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 592 aa  346  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 603 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 610 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 609 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 598 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.18 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  37.05 
 
 		 580 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 598 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 580 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 		 601 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  32.93 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 597 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 597 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 612 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.78 
 
 		 597 aa  320  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 597 aa  319  9e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 598 aa  319  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 599 aa  316  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  32.05 
 
 		 602 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 604 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 606 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  32.83 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0191  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353972  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  32.89 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 604 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 601 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 605 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  31.34 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 601 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 601 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.76 
 
 		 592 aa  306  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 598 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 590 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 607 aa  300  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 596 aa  296  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1560  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 637 aa  296  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.564435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2949  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 591 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179874  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.62 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.49 
 
 		 616 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 		 597 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 601 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 607 aa  290  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 607 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 601 aa  290  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 601 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 613 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 546 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 605 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 612 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 602 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  33.11 
 
 		 679 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 595 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 612 aa  283  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 615 aa  283  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 602 aa  282  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>