More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0545 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  63.15 
 
 		 1277 aa  1637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1280 aa  2647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  57.91 
 
 		 1345 aa  1515    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  58.15 
 
 		 1308 aa  1482    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  57.8 
 
 		 1345 aa  1514    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.47 
 
 		 1371 aa  1495    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.62 
 
 		 1265 aa  1457    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  57.43 
 
 		 1308 aa  1457    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.28 
 
 		 1307 aa  1472    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1511    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.99 
 
 		 1309 aa  1462    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  63.15 
 
 		 1277 aa  1637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1511    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  57.06 
 
 		 1364 aa  1533    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  59.58 
 
 		 1292 aa  1528    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  58.81 
 
 		 1291 aa  1534    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 1218 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  58.36 
 
 		 1324 aa  1533    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  62.39 
 
 		 1259 aa  1616    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  56.13 
 
 		 1307 aa  1469    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1513    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  57.39 
 
 		 1345 aa  1516    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  57.36 
 
 		 1341 aa  1506    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.73 
 
 		 1217 aa  811    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.65 
 
 		 1214 aa  802    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.56 
 
 		 1340 aa  1513    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 		 1212 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1511    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 1210 aa  809    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  57.92 
 
 		 1359 aa  1514    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  39.8 
 
 		 1213 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 		 1227 aa  811    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1511    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  57.04 
 
 		 1307 aa  1489    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.67 
 
 		 1341 aa  1511    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  62.55 
 
 		 1271 aa  1640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  57.41 
 
 		 1300 aa  1491    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  38.46 
 
 		 1218 aa  815    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  56.91 
 
 		 1349 aa  1530    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.55 
 
 		 1289 aa  1987    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 		 1212 aa  817    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  57.67 
 
 		 1324 aa  1518    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  57.55 
 
 		 1342 aa  1513    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  57.34 
 
 		 1292 aa  1481    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.67 
 
 		 1304 aa  1474    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  57.67 
 
 		 1341 aa  1511    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.26 
 
 		 1304 aa  1490    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 		 1221 aa  852    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.08 
 
 		 1288 aa  1819    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  38.22 
 
 		 1202 aa  822    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  57.4 
 
 		 1342 aa  1509    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.34 
 
 		 1340 aa  1510    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.69 
 
 		 1344 aa  1515    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.18 
 
 		 1286 aa  1717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.45 
 
 		 1292 aa  1440    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.72 
 
 		 1279 aa  1497    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.67 
 
 		 1341 aa  1511    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.64 
 
 		 1282 aa  1449    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  57.18 
 
 		 1279 aa  1477    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 		 1187 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 		 1204 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 1183 aa  492  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  31.32 
 
 		 1197 aa  478  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 		 1183 aa  301  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  30.85 
 
 		 1188 aa  280  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.08 
 
 		 434 aa  110  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.94 
 
 		 469 aa  104  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.24 
 
 		 411 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.47 
 
 		 459 aa  102  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.18 
 
 		 461 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  23.24 
 
 		 430 aa  99.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 		 500 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.35 
 
 		 459 aa  97.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  24.16 
 
 		 456 aa  96.3  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  26.26 
 
 		 501 aa  96.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  24.66 
 
 		 490 aa  95.9  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  26.08 
 
 		 431 aa  95.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.47 
 
 		 485 aa  95.5  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  25.77 
 
 		 499 aa  94.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  33.71 
 
 		 987 aa  94.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.64 
 
 		 460 aa  94.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  23.31 
 
 		 952 aa  94.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.25 
 
 		 474 aa  94  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.26 
 
 		 460 aa  93.6  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.26 
 
 		 460 aa  93.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.33 
 
 		 460 aa  93.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  25.58 
 
 		 499 aa  93.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  25.58 
 
 		 499 aa  93.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  23.08 
 
 		 423 aa  93.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  26.49 
 
 		 460 aa  92.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.81 
 
 		 418 aa  92.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  25.75 
 
 		 499 aa  92.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 480 aa  91.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  26.13 
 
 		 497 aa  91.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.49 
 
 		 494 aa  91.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 1010 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  28.65 
 
 		 497 aa  90.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  26.53 
 
 		 499 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  25.9 
 
 		 499 aa  91.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  22.75 
 
 		 1013 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>