150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0425 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0425  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0843  cytochrome c assembly protein  46.86 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4159  cytochrome c assembly protein  42.37 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1939  cytochrome c assembly protein  51.21 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1460  cytochrome c assembly protein  42.32 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4261  cytochrome c assembly protein  41.95 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1065  cytochrome c assembly protein  41.95 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1017  cytochrome c assembly protein  44.08 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  0.587271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1337  hypothetical protein  42.34 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0672  cytochrome c assembly protein  44.06 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2262  cytochrome c assembly protein  41.63 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3403  cytochrome c assembly protein  46.26 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.887838  normal  0.688779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3018  cytochrome c assembly protein  44.15 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00647598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1201  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1371  hypothetical protein  45.8 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15940  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182655  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0521  cytochrome c assembly protein  40.28 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0641  cytochrome c assembly protein  38.33 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1471  hypothetical protein  44.14 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1280  cytochrome c assembly protein  43.24 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2312  cytochrome c assembly protein  39.9 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1708  hypothetical protein  35.58 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.61279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0997  cytochrome c assembly protein  34.58 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2133  cytochrome c assembly protein  37.28 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1986  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39590  Cytochrome c assembly-like protein  53.1 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1177  cytochrome c assembly protein  34.98 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0591  cytochrome c assembly protein  36.47 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0445  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  40 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02262  putative cytochrome C assembly protein  39.23 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0144  hypothetical protein  43.06 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.772264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0056  hypothetical protein  43.06 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.046398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1669  cytochrome c assembly protein  30.77 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2372  transmembrane protein  35.54 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.34584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0202  cytochrome c assembly protein  34.87 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.848267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0046  cytochrome c assembly protein  42.36 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.975637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0127  cytochrome c assembly protein  42.36 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.496419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3369  cytochrome c assembly protein  32.93 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0220  cytochrome c assembly protein  33.47 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.141329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3772  cytochrome c assembly protein  32.11 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002534  CcsA-related protein  32.74 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2810  hypothetical protein  34.32 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.443588  normal  0.1588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3439  cytochrome c assembly protein  32.94 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00951271  hitchhiker  0.000487073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0517  cytochrome c assembly protein  32.23 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.416062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01689  cytochrome c assembly protein  31.91 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000413644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1150  cytochrome C assembly family protein  36.79 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2642  cytochrome c assembly protein  31.78 
 
 		 314 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1047  cytochrome c assembly protein  30.99 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00493417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2513  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3514  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3093  cytochrome c assembly protein  30.5 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349808  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0435  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.75155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1294  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3478  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3516  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3269  cytochrome C assembly family protein  33.61 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03482  hypothetical protein  32.74 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2946  cytochrome c assembly protein  32.58 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1428  permease  40.83 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2922  cytochrome c assembly protein  28.97 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3676  cytochrome c assembly protein  32.67 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0887  hypothetical protein  28.46 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.8995  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0519  cytochrome c assembly protein  31.07 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  0.474671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0494  cytochrome c assembly protein  31.07 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0647  inner membrane protein, putative cytochrome c assembly protein  29.81 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.650824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2645  cytochrome c assembly protein  36.17 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3055  cytochrome c assembly protein  36.17 
 
 		 302 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0093  hypothetical protein  39.6 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2792  cytochrome c assembly protein  31.46 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0561  cytochrome c assembly protein  34.43 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0577846  hitchhiker  0.000678361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2756  cytochrome c assembly protein  28.29 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000043762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0109  cytochrome c assembly protein  34.43 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0591  cytochrome c assembly protein  34.43 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1252  cytochrome c assembly protein  30.66 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000544074  hitchhiker  0.00000156209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4075  cytochrome C assembly family protein  31.42 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3019  cytochrome c assembly protein  30.18 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000524804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2840  cytochrome c assembly protein  30.18 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000354809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2922  cytochrome c assembly protein  30.18 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1208  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3105  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000197765  normal  0.104427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1252  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1285  cytochrome c assembly protein  29.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000446299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1166  cytochrome c assembly protein  30.09 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00369516  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1157  cytochrome c assembly protein  28.44 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000603609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1355  hypothetical protein  29.22 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2937  cytochrome c assembly protein  43 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.390266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3627  cytochrome c assembly protein  43 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.470506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3343  cytochrome c assembly protein  32.21 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0961  cytochrome c assembly protein  42.72 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1061  cytochrome c assembly protein  29.05 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000186655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1623  cytochrome c assembly protein family  40.58 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0256537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0560  cytochrome C assembly protein  40.58 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000010432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0850  cytochrome c assembly protein  31.46 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00175266  hitchhiker  0.0000187767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1063  cytochrome c assembly protein  30.54 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3850  putative cytochrome C assembly protein  30.54 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000010196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2763  putative cytochrome C assembly protein  30.54 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0166622  normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2895  putative cytochrome C assembly protein  30.54 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0885  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.215466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3366  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0757452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>