More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0377 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
365 aa  729    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  56 
 
 
363 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  55.07 
 
 
365 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 
360 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  52.71 
 
 
365 aa  359  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  52.1 
 
 
356 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  48.31 
 
 
368 aa  335  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  51.88 
 
 
364 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  51.59 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  52.37 
 
 
374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 
356 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  51.54 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 
359 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 
359 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
357 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 
356 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  51.25 
 
 
374 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  49.3 
 
 
366 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  51.59 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  51.3 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  51.3 
 
 
357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 
356 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  49.57 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  44.73 
 
 
358 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  45.92 
 
 
371 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 
369 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  46.18 
 
 
363 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  43.21 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  43.55 
 
 
368 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  44.22 
 
 
375 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  43.77 
 
 
370 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  43.82 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  43.77 
 
 
374 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  43.78 
 
 
396 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
360 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
351 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
358 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  36.45 
 
 
363 aa  195  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
356 aa  192  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  40.12 
 
 
362 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.76 
 
 
360 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.57 
 
 
348 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  39.51 
 
 
364 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
349 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
351 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
370 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  39.05 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  38.75 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  38.6 
 
 
356 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  39.06 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  38.93 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  38.37 
 
 
369 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119523  Histidinol-phosphate aminotransferase, chloroplast precursor, probable  34.64 
 
 
409 aa  172  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  35.65 
 
 
363 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
365 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  36.14 
 
 
377 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.43 
 
 
373 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 
374 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
358 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  36.14 
 
 
371 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 
374 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  35.43 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  35.45 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  34.78 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
357 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  30.06 
 
 
356 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 
365 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
369 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 
365 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
357 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
358 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
357 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 
373 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 
366 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  39.29 
 
 
358 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.3 
 
 
387 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3612  histidinol-phosphate aminotransferase  36.47 
 
 
377 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129757  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  38.54 
 
 
371 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>