46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0318 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  76.68 
 
 		 286 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  45.32 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  46.03 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  43.73 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  43.24 
 
 		 265 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  43.24 
 
 		 265 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.86 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  42.07 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.86 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  42.07 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  41.85 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  41.7 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3965  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.86 
 
 		 265 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  43.82 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.47 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  43.65 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4055  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.86 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4131  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.86 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00183874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0081  lipopolysaccharide kinase  42.86 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382008  hitchhiker  0.000743328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03439  hypothetical protein  42.86 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03487  kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide  42.86 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3839  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.45 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000421355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  40.51 
 
 		 268 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  42.45 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.120387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  42.22 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  41.85 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  41.87 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  43.55 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  35.16 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  30 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  30.43 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  30 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  29.81 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  29.81 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  26.92 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  30.14 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  28.19 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  27.23 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  27.03 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  28.19 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.87 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  25.85 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  27.03 
 
 		 244 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  25.83 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>